Алшя протекает по Кайшядорскому и Пренайскому районам, правый приток реки Вяркне.
Длина реки 38 км, площадь бассейна 135 км². Вытекает из озера Швянтис, 9 км на северо-запад от г. Аукштадварис. Впадает в реку Вяркне 25 км от её устья, несколько ниже г. Стаклишкес. Средний уклон 275 см/км. Долина ярче выражена в низовьях. Расход воды в устье: максимальный 30 м³/с, средний 1,06 м³/с, минимальный 0,1 м³/с. Озёра, которых в бассейне реки много, регулирует сток реки, поэтому она даже летом довольно полноводная, а амплитуда половодья меньше 1 м.
Весной или после протяженных дождей
перекаты, порожки, завалы, деревья в русле
ZW/WW 1 (WW2)
Расстояние до устья
33.0 Мост дороги Меджёняй-Сепиёнишкес. п. Гоюс. В русле завалы, плотины бобров. Скорость течения средняя. По берегам лес.
32.3 л. Бунтишкес .
31.0 л. Карве. л. Пааукштоя.
30.6 п. безымянный приток. Уклон реки сильно увеличивается (до моста дороги Норейкишкес-Алшининкай около 900 см/км), в русле валуны, камни, порожки, шиверы; течение сильное. Завалов меньше.
30.2 п. приток.
30.1 л. Вершюкас.
29.5 Брод полевой дороги. л. Гярвишкес.
28.3 л. Йуодупис.
28.0 п. приток.
27.1 л. городища Норейкишкиай.
26.8 Мост дороги Норейкишкес-Алшининкай. л. Норейкишкес п. Квядаришкес. Приближаясь к озеру течение постепенно затихает.
25.8 Алшя впадает в озеро Алшя. Недалеко от южного берега озера городище Пештувенай.
24.7 Река вытекает из озера Алшя. Средний уклон до устья 132 см/км. По берегам лес, редкие перекаты, завалы.
23.7 Мост дороги Стаклишкес-Калвяй. п. Алшининкай.
22.8 Брод полевой дороги.
20.7 п. Виркюс. Брод полевой дороги.
20.5 Мостик.
19.3 л. безымянный приток.
18.9 п. Камайне. п. Кярмошинас.
18.1 л. Зелвис. л. Азия.
17.7 Мост дороги Сундакай-Пештувенай.
17.5 п. безымянный приток.
16.6 л. Мулия.
15.6 п. безымянный приток.
13.4 п. безымянный приток. Река течет лугами, по берегам деревья. Редкие завалы.
13.2 п. безымянный приток.
13.1 п. безымянный приток.
12.4 л. безымянный приток .
12.3 Мост дороги Собува-Стаклишкес. п.Судваришкес. л.Собува.
11.6 п. 2 небольших пруда.
11.0 п. безымянный приток.
9.1 Мостик. л. Багдонишкес.
7.8 Мост дороги Трячёнис-Багдонишкес. Немного выше мостик.
6.2 л. Сулинга.
4.9 Мостик.
4.5 Мостик.
4.4 л. Таурекеле.
3.7 Мост дороги Стаклишкес-Трячёнис. п. Трячёнис. Немного ниже начинается канализированный участок реки, река течет лугами, берега голые. Завалов нет.
3.2 Плотинка. Немного выше мостик.
2.8 Мостик .
2.5 л. Мядуя.
1.4 Мост дороги Вильнюс-Мариямполе. п.Пакровай. Заканчивается канализированный участок реки; по берегам кустарник, деревья; может быть несколько завалов.
0.7 п. приток.
0.0 Река Алшя впадает в реку Вяркне.