J
Jara - Šetekšna (Šventosios baseinas, Šventosios intakas, Anykščių rajonas, Svėdasų seniūnija)
Jiesia (Nemuno baseinas, Nemuno intakas, Prienų, Kauno rajonai, Išlaužo, Gaeliavos, Rokų, Kauno Panemunės seniūnijos)
Jotija (Šešupės baseinas, Šešupės intakas, Šakių rajonas, Kidulių, Sudargo seniūnijos)
Juoda (Nevėžio baseinas, Nevėžio intakas, Panevėžio rajonas, Velžio seniūnija)
Juosta (Nevėžio baseinas, Nevėžio intakas, Panevėžio rajonas, Miežiškių seniūnija)
Jūra (Nemuno baseinas, Nemuno intakas, Rietavo, Šilalės, Tauragės, Pagėgių rajonai)